L'épissage du cancer


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Détermination de la contribution de l'épissage alternatif dans la biologie du cancer

L'épissage alternatif (AS) est un processus post-transcriptionnel par lequel les introns et les exons d'un seul transcrit du gène sont différentiellement épissés pour obtenir plusieurs ARNm matures. Chez les eucaryotes, l'AS joue un rôle central à la fois dans la diversité des protéines et la régulation post-transcriptionnelle. L'épissage alternatif des régions codantes de l'ARNm peut conduire à de multiples isoformes de protéines fonctionnellement différentes à partir d'une seule transcription de gènes. L'AS permet également d'introduire ou de supprimer des éléments de régulation affectant la traduction, la localisation ou la dégradation de l'ARNm.

La majorité des gènes humains sont faits de manière à subir un épissage alternatif. La capacité de l'épissage alternatif à modifier la fonction des protéines et le phénotype cellulaire en a fait un premier suspect pour expliquer certaines des maladies humaines. En effet, l'épissage est désormais reconnu pour être lié à de nombreuses maladies bien connues comme la mucoviscidose, la thalassémie et l'atrophie musculaire spinale.

Nous avons développé des outils permettant l'étude de la fonction des variants d'épissage associés aux cancers. L'utilisation de ces nouvelles techniques bioinformatiques / génomiques développées, nous a permis d'identifier deux groupes différents d'événements d'épissage nécessaires à la survie cellulaire, à la progression du cycle cellulaire et à l'apoptose.

Actuellement, le travail en laboratoire vise à lier les facteurs d'épissage avec le programme d'épissage spécifique au cancer ainsi qu'à identifier les fonctions spécifiques des variants d'épissage dans le microenvironnement de la tumeur et du cycle cellulaire.

 

Références:

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Venables JP, Klinck R, Koh C, Gervais-Bird J, Bramard A, Inkel L, Durand M, Couture S, Froehlich U, Lapointe E, Lucier JF, Thibault P, Rancourt C, Tremblay K, Prinos P, Chabot B, Elela SA. Cancer-associated regulation of alternative splicing. Nat Struct Mol Biol. 2009 Jun;16(6):670-6.


Venables JP, Brosseau JP, Gadea G, Klinck R, Prinos P, Beaulieu JF, Lapointe E, Durand M, Thibault P, Tremblay K, Rousset F, Tazi J, Abou Elela S, Chabot B. RBFOX2 is an important regulator of mesenchymal tissue-specific splicing in both normal and cancer tissues. Mol Cell Biol. 2013 Jan;33(2):396-405.


Prinos P, Garneau D, Lucier JF, Gendron D, Couture S, Boivin M, Brosseau JP, Lapointe E, Thibault P, Durand M, Tremblay K, Gervais-Bird J, Nwilati H, Klinck R, Chabot B, Perreault JP, Wellinger RJ, Elela SA. Alternative splicing of SYK regulates mitosis and cell survival. Nat Struct Mol Biol. 2011 Jun;18(6):673-9.


Brosseau JP, Lucier JF, Lapointe E, Durand M, Gendron D, Gervais-Bird J, Tremblay K, Perreault JP, Elela SA. High-throughput quantification of splicing isoforms. RNA. 2010 Feb;16(2):442-9.